Официально, Алексей умер от остановки сердца 26 июня 1718 года, раскаявшийся и прощенный отцом. Последним что он видел были серые стены камеры в Трубецком бастионе Петропавловской крепости. Ему было всего 28 лет. Отец лично похоронил сына в Петропавловском соборе крепости.