У людей с иммунодефицитным состоянием и/или у новорожденных сальмонелла может проникнуть в различные органы и ткани, с формированием в них гнойных очагов в виде остеомиелитов, артритов, холециститов и т. д. Уже с первых дней идёт поражение ЦНС и сердечно-сосудистой систем.