Инкубационный период может достигать 13 недель, но чаще составляет 3–4 недели после заражения. В течение первых 20–30 дней сифилис носит серонегативный характер, когда тесты на инфекцию отрицательные. Затем наступает серопозитивный период, в котором трепонему уже можно обнаружить лабораторными методами.