При герпетическом стоматите назначают противовирусные препараты. Наиболее эффективными считаются таблетки для сублингвального приема (Эргоферон, Ацикловир, Зовиракс). Если присоединяется вторичная инфекция, проводят курс антибиотикотерапии. При кандидозном стоматите назначают противогрибковые средства для полости рта.